SOFIX関連の学術論文、総説・雑誌の記事、書籍、特許などをまとめました

SOFIX（土壌肥沃度指標）技術の開発者である立命館大学・久保幹教授を中心に発表されたSOFIX関連の学術論文、総説・雑誌等の記事、書籍、特許等をまとめました。
種類別にそれぞれ古い順番に掲載しています。
ご参考になさってください。

Ⅰ：学術論文

	成果年度	論文タイトル	著者名	掲載誌名	巻（号）	ページ
1	1995	Screening of aerobic thermophilic strains and fermentative heat generation by cultivation in rice bran medium	J. OkajimaI. Ohkura, F. Hasumi, and M. Kubo	日本農芸化学会誌	69	1179-1181
2	1996	A novel use of biomass resources	M. Kubo, F. Hasumi, K. Inouye	Bio Industry	13	44-51
3	1998	A novel use of biomass resources -environmental clean up with plant proteins and microorganisms	M. Kubo and F. Hasumi	Recent Res. Devel. in Agricultural & Biological Chem	2	455-465
4	2008	Utilization of biomass based on biorefinery: Development of novel bioactive peptides from soybean waste	Y. Matsumiya and M. Kubo	Research Trends	4	83-91
5	2001	Treatment of hypersaline wastewater with salt tolerance microorganisms	M. Kubo, J. Hiroe, M. Murakami, H. Fukami, and T. TachikiJ. Biosci	Bioeng	91	222-224
6	2001	Promotion of plant growth by soybean waste degrdation products with Streptomyces sp	MF20.N. Hasegawa, H. Akita, and M. Kubo	立命館大学理工学研究所紀要	60巻	59-70
7	2002	Promotion of plant and root growth by soybean meal degradation products	N. Hasegawa, Y. Fukumoto, M. Minoda, A. Plikomol., M. Kubo	Biotechnol. Lett	24	1483-1486
8	2003	Effects of D-methionine or L-methionine on root hair of Brassica rapa	N. Hasegawa, Y. Yamaji, S. Minoda, and M. Kubo J. Biotechnol	Bioeng	95	419-420
9	2006	Isolation and characterization of a bluegill-degrading microorganism, and analysis of the plant growth-promoting effect of the degraded products	S. Sanpa,S. Sumiyoshi, T. Kujira, Y. Matsumiya, and M. Kubo	Biosci. Biotech. Biochem	70	340-347
10	2006	Effect of charcoal from woody waste on the soil bacterial biomass and its plant-growth promoting effect	S. Sanpa,K. Imaki, J. Konishi, A. Shibata, Y. Matsumiya, and M. Kubo	Woody Carbonization Res	2	37-42
11	2006	Evaluation of soil bacterial biomass by environmental DNA extracted by slow-stirring method	H. Aoshima, A. Kimura, A. Shibutani, C. Okada, Y. Matsumiya, and M. Kubo	Appl. Microbiol. Biotechnol.	71	875-880
12	2006	Fats and oils-containing wastewater treatment with fats and oils-degrading microorganisms (油脂分解微生物を用いた油脂含有廃水処理)	木村彰成、久保幹	オレオサイエンス	6	501-506
13	2007	Isolation and characterization of a lipid-degrading bacterium and its application to lipid-containing wastewater treatment	Y. Matsumiya, D. Wakita, A. Kimura, S. Sanpa, and M. KuboJ. Biotechnol	Bioeng	103	325-330
14	2007	Effect on epidermal cell of soybean protein-degraded products and structural determination of the root hair promoting peptide	Y. Matsumiya, S. Sumiyoshi, T. Matsukura, and M. Kubo	Appl. Microbiol. Biotechnol	77	37-43
15	2010	農地土壌診断－有機農法のための農地物質循環の評価－	松野敏英、津田治敏、久保田謙三、松宮芳樹、久保幹	立命館大学理工学研究所紀要	68号	85-90
16	2011	Soybean peptide: Novel plant growth promoting peptide from soybean	Y. Matsumiya and M. Kubo	In Teck, Edited by H. A. El-Shemy		215-230
17	2010 （2011）	土壌環境中における窒素循環の新規評価法	津田治敏、松野敏英、久保田謙三、松宮芳樹、久保幹	立命館大学理工学研究所紀要	69号	39-46
18	2012	Analysis of peptide uptake and location of root hair-promoting peptide accumulation in plant roots	Y. Matsumiya, R. Taniguchi, and M. Kubo	J. Peptide Science	18	177-182
19	2013	Isolation and identification of phytate degrading bacteria and their contribution to phytate mineralization in soil	S. Horii, T. Matsuno, J. Tagomori, M. Mukai, D. Adhikari, and M. Kubo	J. Gen. Appl. Microbiol	59	353-360
20	2013	Soybean as a nitrogen supplier	Y. Matsumiya, S. Horii, T. Matsuno, and M. Kubo	In Teck, Edited by James E. Board		49-60
21	2013	Analysis of nitrification in agricultural soil and improvement of nitrogen circulation with autotrophic ammonia-oxidizing bacteria	T. Matsuno, S. Horii, T. Sato, Y. Matsumiya, and M. Kubo	Appl. Biochem. Biotechnol	169	795-809
22	2013	Distribution of Hydrocarbon Degrading Bacteria in the Soil Environment and their Contribution to Bioremediation	Y. Fukuhara, S. Horii, T. Matsuno, Y. Matsumiya, M. Mukai, and M. Kubo	Appl. Biochem. Biotechnol	170	329-339
23	2014	Evaluation of soil fertility for plant growth based on bacterial biomass and material circulation in soil environmen	M. Kubo, S. Horii, T. Matsuno, M. Mukai, and D. Adhikari	Recent Development in Biotechnology, Fertilizer Technology II, Biofertilizer, J. N. Govil (ed.)		147－160
24	2014	Proposal for a soil fertility index (SOFIX) for organic agriculture and construction of a SOFIX database for agricultural fields	D. Adhikari, T. Kai, M. Mukai, K. S Araki, and M. Kubo	Current Topics in Biotechnology	8	81-91
25	2015	Physical and biological properties of apple orchard soils of different productivities	T. Kai, M. Kukai, K. S. Araki, D. Adhikari, and M. Kubo	Open J. Soil Sci	5	149-156
26	2015	Development of an efficient bioremediation system for petroleum hydrocarbon contaminated soils based on hydrocarbon degrading bacteria and organic material control	D. Adhikari, K. S. Araki, M. Mukai, T. Kai, K. Kubota, T. Kawagoe, and M. Kubo	Austin J. Biotechnol. & Bioengi	2	1-7
27	2016	Degradation of bioplastics in soil and their degradation effects on environmental microorganisms	D. Adhikari, M. Mukai, K. Kubota, T. Kai, N. Kaneko, K. S. Araki, and M Kubo	J. Agri. Chem. Environ	5	23-24
28	2016	Analysis of chemical and biological soil properties in organically and conventionally fertilized apple orchards	T. Kai, M. Mukai, K. S. Araki, D. Adhikari, and M. Kubo	J. Agri. Chem. Environ	5	92-99
29	2016	Construction of soil fertile index (SOFIX) based on microorganisms and application for agriculture	M. Kubo, M. Mukai, and D. Adhikari	J. Environ. Biotechnol	15	85-90
30	2016	Stimulation of soil microorganisms in pesticide-contaminated soil using organic materials	D. Adhikari, I. Y. Perwire, K. S. Araki, and M. Kubo	AIMS Bioengi	3	379-388
31	2016	Comparison of soil properties between upland and paddy fields based on the soil fertility index (SOFIX)	K. S. Araki, I. Y. Perwira, D. Adhikari, and M. Kubo	Current Trends in Microbiology	10	85-94
32	2017	Construction of a new water treatment system based on material circulation	I. Y. Perwire,T. Hanashiro, L. Nimatus, D. Adhikari, K. S. Araki, M. Kubo,J. Water	Resource and Protection	9	1014-1025
33	2017	Soil preparation based on microorganisms –soil fertility index (SOFIX)	T. Kai, D. Adikari, and M. Kubo	Irrigation, Drainage and Rural Engi. J	85	15-18
34	2017	Relationship among phosphorous circulation activity, bacterial biomass, pH, and mineral concentration in agricultural soil	D. Adhikari, T. Jiang, T. Kawagoe, T. Kai, K. Kubota, K. S. Araki, and M. Kubo	Microorganisms	5	79-90
35	2018	Suitable soil conditions for tomato cultivation under an organic farming system	D. Adhikari, Y. Kobashi, T. Kai, T. Kawagoe, K. Kubota, K. S. Araki, and M. Kubo	J. Agri. Chem. And Environ	7	117-132
36	2019	Construction of organic soil based on soil fertility index (SOFIX)	M. Kubo, P. Pholkaw, Q. T. Tran, K. S. Araki	Proceedings of International Workshop on Enabling Capacity in Production and Application of Bio-pesticides and Bio-fertilizers for Soil-borne Disease Control and Organic Farming		1-8
37	2019	Utilization of wood biomass for organic soil based on the soil fertility index (SOFIX)	P. Pholkaw, A. Muraji, K, Maeda, T. Kawagoe, K. Kubota, S. Sanpa, Q. T. Tran, and M. Kubo	J. Agir, Chem. and Environ	8	224-236
38	2019	Bacillus subtilisの土壌環境および植物成長に及ぼす影響解析	東本繰未、柴田徹、平野晧巳、仲原慎太郎、曽我俊博、荒木希和子、久保幹	立命館大学理工学研究所紀要	78号	19-35
39	2020	Characterization of orchard fields based on Soil Fertility Index (SOFIX)	P. Pholkaw, Q. T. Tran, T. Kai, T. Kawagoe, K. Kubota, K. S. Araki, and M. Kubo	J. Agir, Chem. and Environ

Ⅱ：雑誌・総説等

	成果年度	論文タイトル	著者名	掲載誌名	巻（号）	ページ
1	1997	生物工学的環境浄化のための微生物の挙動解析	M. Kubo	生物工学会誌	75	202
2	1999	土壌環境と微生物－土壌微生物の解析－	久保幹	生物工学会誌	77	478
3	2000	高濃度NaCl含有廃水処理システム－特殊微生物の挙動と重要性	M. Kubo and M. Murakami	J. Water and Waste	42	738-739
4	2004	植物生長促進ペプチドを生成する起源大豆たん白質の解析	久保幹、山地洋平、松倉琢磨、住吉紗世子、平野聡子	大豆たん白質研究	7	85-89
5	2005	環境遺伝子を用いた環境診断－簡便かつ高精度な環境微生物定量技術－	松宮芳樹、木村彰成、青島央江、井元俊之、井元健二、久保幹	実用産業情報	35	24-30
6	2006	アミノ酸より分子の大きいペプチドの吸収で根毛がワッと出る「有機肥料は化学肥料と何かが違う」の謎に迫る	久保幹	現代農業	10月号	288-292
7	2008	厄介ものブルーギルから高機能養鶏飼料へ－飼料代削減に期待－	松宮芳樹、久保幹	養鶏の友	10月号	20-23
8	2012	農地窒素循環の見える化－物質循環系を考えた土づくり－	松野敏英、堀井幸江、福原優樹、松宮芳樹、久保幹	土づくりとエコ農業	６・７月号	50-55
9	2015	環境保全型農業の現状とこれからの展望	久保幹	農耕と園芸	70	12-16
10	2016	SOFIXでわかる畑の微生物量とＣ／Ｎ比	久保幹	現代農業	12月号	112-115
11	2018	畑が生まれ変わる理想の堆肥	久保幹（監修）	やさい畑	秋号	8-29
12	2019	土壌燻蒸で激減する畑の「菌力」	久保幹	現代農業	10月号	74-77

Ⅲ：書籍

	成果年度	書籍名	著者名	出版社	巻（号）	ページ
1	2012	環境微生物学	久保幹、森崎久雄、久保田謙三、今中忠行	化学同人
2	2013	バイオテクノロジー第2版大学教育出版、（2013）	久保幹、新川英典、竹口昌之、蓮実文彦	大学教育出版
3	2013	遺伝子とタンパク質のバイオサイエンス	杉山政則、久保幹、熊谷孝則	共立出版
4	2013	有機農業における新たな土壌診断の可能性（土壌肥沃度指標：SOFIX））	久保幹	野菜情報、（独）農畜産推進機構	111	2-3
5	2013	有機農業のための畑の診断指標SOFIX	久保幹	現代農業	10月号	252－255
6	2017	土壌づくりのサイエンス	久保幹	成文堂新光社
7	2019	極限環境生物の産業展開		シーエムシー出版（普及版）
8	2020	最新農業技術　土壌施肥		農文協	vol. 12

Ⅳ：特許

	成果年度	特許番号等	発明者	発明の名称
1	2002	特許第3366962号	久保幹、廣江淳一、村上誠、深海浩	耐塩性バチルス・セレウスCH-6菌および高塩濃度廃液の処理方法
2	2002	特許第3322277号	久保幹、雨宮博、岡島壽一、蓮実文彦	バチルス・サーキュランス新規菌株
3	2002	特許第3431611号	久保幹、雨宮博、岡島壽一、蓮実文彦	バチルス・ステアロサーモフィルス新規菌株およびこれを用いた大豆粕由来の植物成長肥料
4	2004	特許第3577485号	久保幹，雨宮博，岡島壽一、蓮実文彦	バチルス・サーキュランス新規菌を用いた大豆粕由来植物成長肥料
5	2009	国際特許出願 PCT出願番号 PCT／JP2010／54892	久保田謙三、石森洋行、松宮芳樹、深川良一、久保幹、門倉伸行、金森章雄	新規土壌診断方法
6	2010	アメリカ出願番号 13/256,757	久保田謙三、石森洋行、松宮芳樹、深川良一、久保幹、門倉伸行、金森章雄	新規土壌診断方法
7	2010	オーストラリア出願番号 2010225633	久保田謙三、石森洋行、松宮芳樹、深川良一、久保幹、門倉伸行、金森章雄	新規土壌診断方法
8	2010	特許第4635520号	住吉紗世子、松倉琢磨、山地洋平、原口太和、平野聡子、久保幹	植物成長促進剤
9	2010	特許第4646571号	平野聡子、久保幹、箕田正史	不定根形成促進剤
10	2011	特許第4688471号	久保幹、箕田正史	新規生理活性ペプチド
11	2013	特許第5219390号	崎濱由梨、畑山耕太、伊藤浩司、馬淵信行、久保幹	微生物培養用培地及び微生物製剤
12	2013	特許第5578525号	久保田健三、石森洋行、松宮芳樹、深川良一、久保幹、門倉伸行、金森章雄	新規土壌診断方法
13	2014	特許第5068277号	久保幹、久保田健三、石森洋行、松宮芳樹、深川良一、門倉伸行、金森章雄	バイオオーグメンテーションにおける環境評価方法
14	2015	特許第5674258号	久保幹、松宮芳樹、松山高広	家禽用生育促進剤及びそれを含有する家禽用飼料
15	2017	特許6238238号	久保幹、篠崎彰大、平井敏治、向真樹、Dinesh Adhikai	水浄化処理装置及び水浄化処理方法

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